Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms