Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms