Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp4Q9WV89 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms