Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms