Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ArcQ9WV31 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArcQ9WV31 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms