Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUT7

Ccr9, C-C chemokine receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr9Q9WUT7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr9Q9WUT7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr9Q9WUT7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms