Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srd5a3Q9WUP4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms