Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lemd3Q9WU40 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lemd3Q9WU40 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lemd3Q9WU40 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lemd3Q9WU40 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lemd3Q9WU40 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lemd3Q9WU40 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lemd3Q9WU40 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lemd3Q9WU40 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lemd3Q9WU40 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lemd3Q9WU40 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms