Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms