Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms