Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2l3Q9WTM4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2l3Q9WTM4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms