Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PplQ9R269 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PplQ9R269 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PplQ9R269 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PplQ9R269 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PplQ9R269 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PplQ9R269 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PplQ9R269 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms