Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TapbpQ9R233 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.9 ms