Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcc6Q9R1S7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcc6Q9R1S7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms