Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms