Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubd1Q9R1K7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms