Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrpxQ9R0M3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrpxQ9R0M3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms