Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NrkQ9R0G8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NrkQ9R0G8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms