Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms