Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d3cQ9QZS8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms