Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas3Q9QZQ0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms