Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Usp21Q9QZL6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Usp21Q9QZL6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Usp21Q9QZL6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Usp21Q9QZL6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Usp21Q9QZL6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Usp21Q9QZL6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Usp21Q9QZL6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Usp21Q9QZL6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Usp21Q9QZL6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
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Usp21Q9QZL6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Usp21Q9QZL6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp21Q9QZL6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Usp21Q9QZL6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Usp21Q9QZL6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Usp21Q9QZL6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Usp21Q9QZL6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Usp21Q9QZL6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Usp21Q9QZL6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms