Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ercc4Q9QZD4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms