Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms