Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms