Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnt3Q9QZ47 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms