Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmeff2Q9QYM9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms