Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp3Q9QY23 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms