Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nufip1Q9QXX8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms