Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx8Q9QXV1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms