Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms