Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyhr1Q9QXA1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyhr1Q9QXA1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms