Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms