Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rai2Q9QVY8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms