Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms