Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmub1Q9JMG3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmub1Q9JMG3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms