Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms