Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg4Q9JM99 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg4Q9JM99 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg4Q9JM99 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg4Q9JM99 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg4Q9JM99 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg4Q9JM99 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg4Q9JM99 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg4Q9JM99 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg4Q9JM99 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prg4Q9JM99 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms