Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1aQ9JLR9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Higd1aQ9JLR9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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