Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Cabp1Q9JLK7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cabp1Q9JLK7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms