Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkd2l2Q9JLG4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms