Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms