Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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SacsQ9JLC8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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SacsQ9JLC8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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SacsQ9JLC8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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SacsQ9JLC8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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SacsQ9JLC8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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SacsQ9JLC8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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