Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hip1rQ9JKY5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hip1rQ9JKY5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hip1rQ9JKY5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hip1rQ9JKY5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hip1rQ9JKY5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hip1rQ9JKY5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hip1rQ9JKY5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hip1rQ9JKY5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hip1rQ9JKY5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms