Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms