Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms