Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrac1Q9JKP8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms