Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms