Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod2Q9JKK7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod2Q9JKK7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod2Q9JKK7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod2Q9JKK7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod2Q9JKK7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod2Q9JKK7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod2Q9JKK7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod2Q9JKK7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod2Q9JKK7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod2Q9JKK7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms