Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nectin1Q9JKF6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms